根据《中共厦门市委 厦门市人民政府关于进一步调整市级重大片区、重大项目指挥部运行机制的通知》（厦委〔2017〕37号）精神，6月21日，市政府办公厅下发《关于调整集美新城开发建设指挥部的通知》（厦府办网传〔2017〕17号），由副市长李辉跃任指挥部总指挥，集美区区长何东宁任第一副总指挥，集美区政协副主席、指挥部原副总指挥陈友谊任常务副总指挥，市政府副秘书长沈顺文、火炬管委会主任黄晓舟、集美区常务副区长孙建辉、集美区正处级干部庄源源等任副总指挥，其中，庄源源兼任办公室主任。指挥部下设办公室、规划建设部、征地拆迁和安全保障部、产业招商部、督查审计部。